结构调整是指在经济发展过程中，由于市场需求、技术进步等因素的变化，企业需要调整生产、经营方式和产品结构的过程。在进行结构调整时，可能会出现阵痛期，主要有以下几个原因：

1. 产能过剩：在市场竞争激烈的情况下，一些企业可能会出现产能过剩的问题，导致生产成本增加、利润下降。为了应对这种情况，企业需要削减产能，进行裁员等措施，这可能会引发员工不满情绪，造成阵痛期。

2. 技术更新换代：随着科技的发展，一些新技术会不断涌现，取代原有的生产方式和产品。企业为了保持竞争力，需要及时更新技术，进行生产设备的更新换代。这种调整可能会导致旧设备淘汰、员工技能更新等问题，引发阵痛期。

3. 市场需求变化：消费者的需求会随着时代和市场的变化而变化，一些过时的产品可能会受到市场冷落，企业需要调整产品结构以适应市场需求。这种调整可能会导致产品线调整、市场推广等问题，引发阵痛期。

总的来说，结构调整会引发阵痛期的主要原因是因为调整过程中可能会涉及到企业内部的人员、设备、产品等方面的变化，这些变化可能会对企业造成一定程度的影响和压力，需要一定的时间和资源来适应和应对。